Anduviste en la inyección? A mi hace poco por culpa de regular la inyección me dió problemas con el encendido, se ahogaba por exceso de gasolina (olía a gasolina, iba a tirones, en definitiva iba gorda de gasolina)
También puedes mirar si te da algún error de diagnóstico (DIAG) enchufando los conectores famosos que hay en la derecha del subchásis y encendiendo la moto.
Ráfagas!