Bueno, como te has portado bien con las fotos... vamos a empezar con un par de ideas.
Filtro de aire. Yo llevo puesto K&N pero, si tuviera que poner uno nuevo, creo que pondría Pipercross:
http://www.ebay.es/itm/AL-1004-APRILIA-TUONO-1000-R-2006-2009-K-N-HIGH-FLOW-AIR-FILTER-/290639483393?pt=UK_Motorcycle_Parts&hash=item43ab769201#ht_1976wt_1186
http://www.ebay.es/itm/Aprilia-RSV1000-04-08-Pipercross-Air-Filter-Tuono-06-08-/400083951654?pt=UK_Motorcycle_Parts&hash=item5d26dca026#ht_2386wt_1186
Escapes. De vez en cuando aparecen por aquí ofertas de algún forero que vende la moto y se deshace antes de los escapes. No se si en este momento hay algo por ahí que merezca la pena, si no, no tardarán en salir. Yo miraría algo tipo Akra, Arrow o Leo, aunque me encantan también los Mivv Suono. Si los miras nuevos ya sabes lo que hay (€€€), yo esperaría un poco.
Anticaídas. Yo buscaría algo tipo LSL o Woodcraft, la marca da igual, el caso que vayan anclados al chasis en dos puntos, que no sean un tornillo con un taco de nylon al final (lo digo por experiencia propia). Me parece que los originales de Aprilia también están bien. En cuanto a precio y estética lo que mejor te encaje...
Yo, como siempre, lo miro casi todo en Ebay:
http://www.ebay.es/itm/LSL-Sturzpad-Befestigung-Aprilia-Tuono-RSV-Mille-06-07-crash-pad-fixing-kit-/360623249990?pt=Motorrad_Kraftradteile&hash=item53f6d21a46#ht_2780wt_989
http://www.ebay.com/itm/330899547411?item=330899547411&pt=Motorcycles_Parts_Accessories&cmd=ViewItem&hash=item4d0b266513&vxp=mtr
Poco a poco!!! 